En el año 20XX se extiende un sospechoso brote de la gripe robótica Roboenza. Se esparce por el mundo como la pólvora derribando a todo tipo de robots. Los infectados han quedado fuera de control, destruyendo la ciudad. Como no podía ser de otra forma, Mega Man afrontará esta amenaza y le ajustará las cuentas al responsable.
